一組艾滋病研究人員，細(xì)胞生物學(xué)家和生物物理學(xué)家共同支持COVID-19科學(xué)，他們確定了冠狀病毒蛋白的原子結(jié)構(gòu)，認(rèn)為該蛋白有助于病原體逃避和抑制人類免疫細(xì)胞的反應(yīng)。結(jié)構(gòu)圖-現(xiàn)在發(fā)表在PNAS雜志上，但自8月以來(lái)一直為科學(xué)界開放使用-為專門針對(duì)SARS-CoV-2量身定制的新型抗病毒治療奠??定了基礎(chǔ)，并使得能夠進(jìn)一步研究新出現(xiàn)的病毒破壞了人體。

 

“使用X射線晶體學(xué)，我們建立了ORF8的原子模型，并突出顯示了兩個(gè)*的區(qū)域：一個(gè)僅存在于SARS-CoV-2及其直接的蝙蝠祖先中，另一個(gè)不存在任何其他冠狀病毒。”加州大學(xué)伯克利分校教授，勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(伯克利實(shí)驗(yàn)室)的前任科學(xué)家詹姆斯·赫里(James Hurley)說(shuō)。“這些區(qū)域穩(wěn)定了這種蛋白質(zhì)，這種蛋白質(zhì)是一種分泌性蛋白質(zhì)，不像病毒的特征性突突蛋白質(zhì)那樣與膜結(jié)合，并創(chuàng)造了新的分子間界面。我們和研究界的其他人認(rèn)為，這些界面參與了某種程度上引起反應(yīng)的反應(yīng)。 SARS-CoV-2的病原性比其進(jìn)化株高。”

聚焦結(jié)構(gòu)生物學(xué)

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)圖的生成總是很費(fèi)力的，因?yàn)榭茖W(xué)家們必須設(shè)計(jì)細(xì)菌，這些細(xì)菌可以抽出大量分子，將分子操縱為純晶體形式，然后對(duì)晶體進(jìn)行許多X射線衍射成像。這些圖像-由X射線束反射出晶體中的原子并穿過(guò)晶格中的縫隙，產(chǎn)生斑點(diǎn)圖案產(chǎn)生-通過(guò)特殊軟件進(jìn)行組合和分析，以確定每個(gè)原子的位置。根據(jù)蛋白質(zhì)的復(fù)雜程度，這一艱苦的過(guò)程可能需要數(shù)年時(shí)間。

對(duì)于許多蛋白質(zhì)，通過(guò)將未溶解分子的結(jié)構(gòu)與其他具有相似氨基酸序列的蛋白質(zhì)(已作圖)進(jìn)行比較，可以幫助構(gòu)建圖譜。科學(xué)家可以對(duì)蛋白質(zhì)如何折疊成3D形狀做出明智的猜測(cè)。

但是對(duì)于ORF8，團(tuán)隊(duì)必須從頭開始。ORF8的氨基酸序列與其他蛋白質(zhì)*不同，因此科學(xué)家對(duì)其整體形狀沒(méi)有參考，而蛋白質(zhì)的3D形狀決定了其功能。

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來(lái)源：生物幫

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